Seguindo os melhores preceitos de higiene este Hospital foi originalmente constituído por espaços destinados a doentes em isolamento, a doentes graves e a doentes em convalescença, e ainda por salas de pessoal médico e de “cirurgia”.
Nesta enfermaria os doentes eram assistidos por frades enfermeiros, pelo médico e pelo sangrador, existindo 16 compartimentos com camas voltadas para o altar, para que os doentes pudessem assistir à missa.
Esta enfermaria do século XVIII é provavelmente a única que sobreviveu intacta na Europa.
